Koper Szlovénia legfontosabb kikötővárosa az olasz határ közelében. Eredetileg egy szigeten állt, egyik korai elnevezése is innen ered: Kecske-sziget (Caprea, azaz Koper, ez az elnevezés a római korból származik). Az ókorban Aegida néven említik görög források. A longobárdok támadása elől 568-ban ide menekültek Tergestum(a mai Trieszt) lakói.A 7. században átkeresztelték Justinopolis-ra, II. Jusztinianosz bizánci császár tiszteletére. Később a környező lagúnás tengerág feltöltésével félsziget lett belőle.A 13. században került a város az aquileai pátriárkák kezébe, akik székhelyükké tették meg és a CaputHistriae, vagyis az Isztria fővárosa nevet adták neki, ami a mai olasz nevének középkori elődje. A várost megerősítették és ebből a korszakból származik néhány legszebb épülete, beleértve a katedrálist és a palotákat is.Koper a 15-16. században, a Velencei Köztársaság idején élte aranykorát.Amikor a 20 km-re tőle fekvő Trieszt a 18. század elején vámmentessé tette kikötőjét, Koper elvesztette jelentőségét. 1798-tól 1918-ig az Osztrák Császárság része, majd 1947-ig az Olasz Királyságé. Ez évben alakult meg Trieszt Szabad Terület, amelynek B zónájához tartozott, majd annak 1954-es felosztásával Jugoszláviához került. Az 1991-ben vált függetlenné Szlovénia, és Koper ismét jelentős kikötőváros lett.
